Deux nouveaux pensionnaires se présentent au manoir en deux jours ! D'abord Alisande, une jeune fille ravissante, qui arrive... en barque ! Elle ne veut pas dire d'où elle vient, mais elle est marquée par le souvenir d'un incendie et se sent terriblement coupable. C'est suffisant pour que Liam ait envie d'en savoir plus. Le second, Désiré, semble moins tourmenté. Il a toujours le sourire et sait se faire apprécier de tous. Le docteur Roy leur attribue une chambre à l'étage des fantômes blancs. Pourtant...
Jamais le manoir n'a connu une telle activité : deux nouveaux en deux jours ! Alisande, une ravissante jeune fille blonde, est arrivée par barque. Nul ne sait d'où elle vient. Toutefois, elle croit se souvenir d'un incendie et ressent une immense culpabilité. Des indices suffisants pour que Liam ait envie d'entamer une enquête. L'autre nouveau venu, Désiré, semble moins tourmenté. Il a toujours le sourire aux lèvres et sait se faire apprécier de tous. Après les avoir accueillis, le docteur Roy attribue à chacun d'eux une chambre à l'étage du manoir - celui des fantômes blancs - où ils vivront avec les autres pensionnaires. Pourtant...
Draco est choisi par une pierre magique pour devenir maître-dragon. Comme Ana, Bo et Fira, les trois autres enfants élus, il est chargé d'entraîner un dragon pour l'armée secrète de leur roi. Mais Vermisso, son dragon, ressemble à un ver de terre géant et ne crache ni feu, ni eau, ni lumière. La pierre-dragon s'est-elle trompée ?
Le roi Roland a décidé de présenter son armée de dragons au monde. Draco, Ana, Bo et Fira, les apprentis maîtres-dragons, sont ravis ! Mais alors qu'ils répètent pour le spectacle, Vulcain, le dragon de Fira, manque de brûler le roi. Roland décide de l'exclure de la cérémonie. Il ne veut pas non plus de Vermisso, la monture de Draco qui ressemble trop à un ver de terre. Bo et Ana partent avec Aloïs, le sorcier chargé de leur apprentissage, tandis que Draco et Fira restent au palais. Les voilà seuls et livrés à eux-mêmes avec leurs dragons. Profitant de la situation, le terrible Maldred apparaît, chevauchant son dragon vert à quatre têtes. Le mage noir a dans l'idée de kidnapper Vermisso, pour contrôler ses pouvoirs...
Jacob Portman est de retour chez lui, en Floride, là où tout a commencé. Et cette fois, son rêve est devenu réalité : Miss Peregrine et les enfants particuliers sont à ses côtés. Ces derniers découvrent, fascinés, le monde moderne. Afin de faciliter leur intégration, Jacob est chargé de leur donner des cours de normalité. Au programme : plage, baignade, et leçons particulières... Mais la découverte d'un mystérieux bunker dans la maison de son grand-père va tout changer. Persuadé qu'Abe lui a laissé des indices pour sauver des enfants particuliers isolés, Jacob entraîne ses amis sur les routes. C'est le début d'un jeu de piste dangereux, à travers un long périple dans l'Amérique d'aujourd'hui, territoire étrange, aux espaces parallèles peuplés de créatures d'un autre temps.